Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Grik3B1AS29 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 AC165138.1-201ENSMUST00000226984 270 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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