Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm22672-201ENSMUST00000104414 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm26425-201ENSMUST00000122529 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Gm24946-201ENSMUST00000158332 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Gm25382-201ENSMUST00000157811 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Limd1Q9QXD8 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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