Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Mir216a-201ENSMUST00000083605 72 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Cln8Q9QUK3 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm24323-201ENSMUST00000175342 77 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Cln8Q9QUK3 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 309.1 ms