Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm23652-201ENSMUST00000116752 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm26253-201ENSMUST00000122493 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Mir3083-201ENSMUST00000175377 64 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm25289-201ENSMUST00000122799 119 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm25887-201ENSMUST00000157777 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Gm24099-201ENSMUST00000083384 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm26051-201ENSMUST00000104642 93 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 CT571266.1-201ENSMUST00000222859 153 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm43206-201ENSMUST00000197990 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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