Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Uchl3Q9JKB1 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
Uchl3Q9JKB1 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Uchl3Q9JKB1 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Uchl3Q9JKB1 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Uchl3Q9JKB1 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Uchl3Q9JKB1 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Uchl3Q9JKB1 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
Uchl3Q9JKB1 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Uchl3Q9JKB1 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm23278-201ENSMUST00000157911 143 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Mir3065-201ENSMUST00000198674 87 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm24884-201ENSMUST00000158784 119 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC-0.62□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm25885-201ENSMUST00000157779 109 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm25032-201ENSMUST00000175411 84 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Uchl3Q9JKB1 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Gm22838-201ENSMUST00000158437 99 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Gm22962-201ENSMUST00000157962 73 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Mir145a-201ENSMUST00000083658 70 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Gm23180-201ENSMUST00000158686 125 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Mir344-2-201ENSMUST00000175446 80 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.68□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Gm23314-201ENSMUST00000157218 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Uchl3Q9JKB1 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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