Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm22490-201ENSMUST00000157188 119 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm22055-201ENSMUST00000083388 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm22004-201ENSMUST00000101884 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Mir450b-201ENSMUST00000102095 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm24877-201ENSMUST00000158779 116 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm26498-201ENSMUST00000177799 79 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm26230-201ENSMUST00000180141 79 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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