Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc39Q9D5Y1 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc39Q9D5Y1 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc39Q9D5Y1 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc39Q9D5Y1 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccdc39Q9D5Y1 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccdc39Q9D5Y1 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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