Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC0.28□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Zbed3Q9D0L1 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Mir669f-201ENSMUST00000103850 121 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Zbed3Q9D0L1 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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