Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Shmt2Q9CZN7 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Shmt2Q9CZN7 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Shmt2Q9CZN7 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Shmt2Q9CZN7 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Shmt2Q9CZN7 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Shmt2Q9CZN7 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
Shmt2Q9CZN7 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Shmt2Q9CZN7 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Shmt2Q9CZN7 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Shmt2Q9CZN7 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Shmt2Q9CZN7 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Shmt2Q9CZN7 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Shmt2Q9CZN7 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Shmt2Q9CZN7 Gm23735-201ENSMUST00000082551 134 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Shmt2Q9CZN7 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Shmt2Q9CZN7 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Shmt2Q9CZN7 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm24579-201ENSMUST00000103964 144 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Mir3109-201ENSMUST00000175301 88 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Snord32a-201ENSMUST00000083285 83 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Shmt2Q9CZN7 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Mir695-201ENSMUST00000102261 109 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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