Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Rprd1bQ9CSU0 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm22757-201ENSMUST00000102279 96 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Rprd1bQ9CSU0 Mir3470a-201ENSMUST00000175223 77 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Rprd1bQ9CSU0 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Rprd1bQ9CSU0 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Rprd1bQ9CSU0 Snord91a-201ENSMUST00000104305 93 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm23278-201ENSMUST00000157911 143 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm25149-201ENSMUST00000157119 82 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm22942-201ENSMUST00000158563 124 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm23180-201ENSMUST00000158686 125 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Mir344-2-201ENSMUST00000175446 80 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm23442-201ENSMUST00000082919 134 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm24796-201ENSMUST00000104007 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Mir214-201ENSMUST00000083582 110 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm25885-201ENSMUST00000157779 109 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm22962-201ENSMUST00000157962 73 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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