Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PtprtQ99M80 Gm23308-201ENSMUST00000179475 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PtprtQ99M80 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PtprtQ99M80 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PtprtQ99M80 Gm26104-201ENSMUST00000157250 108 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PtprtQ99M80 Gm22542-201ENSMUST00000158166 95 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PtprtQ99M80 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PtprtQ99M80 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PtprtQ99M80 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PtprtQ99M80 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PtprtQ99M80 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PtprtQ99M80 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PtprtQ99M80 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PtprtQ99M80 Gm22430-201ENSMUST00000158546 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PtprtQ99M80 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PtprtQ99M80 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PtprtQ99M80 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PtprtQ99M80 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PtprtQ99M80 Gm23166-201ENSMUST00000157164 101 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PtprtQ99M80 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PtprtQ99M80 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PtprtQ99M80 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PtprtQ99M80 Mir7218-201ENSMUST00000200050 59 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PtprtQ99M80 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
PtprtQ99M80 Mir543-201ENSMUST00000102286 76 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm24580-201ENSMUST00000103965 131 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm22732-201ENSMUST00000158093 121 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm27749-201ENSMUST00000183651 125 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm43038-201ENSMUST00000202359 88 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm22455-201ENSMUST00000082580 71 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm22385-201ENSMUST00000158189 101 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm25993-201ENSMUST00000175391 80 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm25905-201ENSMUST00000158490 101 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 mt-Tw-201ENSMUST00000082397 67 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC-1.7□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm17522-202ENSMUST00000186631 174 ntTSL 1 (best) BASIC-1.7□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm17412-202ENSMUST00000189566 174 ntTSL 1 (best) BASIC-1.7□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.7□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC-1.7□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm25296-201ENSMUST00000082566 67 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm25337-201ENSMUST00000083723 104 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm22720-201ENSMUST00000122710 87 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm25366-201ENSMUST00000158845 124 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PtprtQ99M80 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm25055-201ENSMUST00000157369 76 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC-1.73□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm23316-201ENSMUST00000157997 114 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC-1.74□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm24971-201ENSMUST00000175581 110 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
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