Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ssh3Q8K330 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ssh3Q8K330 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ssh3Q8K330 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Ssh3Q8K330 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ssh3Q8K330 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ssh3Q8K330 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ssh3Q8K330 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Ssh3Q8K330 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ssh3Q8K330 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ssh3Q8K330 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ssh3Q8K330 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ssh3Q8K330 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ssh3Q8K330 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ssh3Q8K330 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ssh3Q8K330 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ssh3Q8K330 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ssh3Q8K330 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ssh3Q8K330 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ssh3Q8K330 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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