Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm44385-201ENSMUST00000198781 81 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Usp38Q8BW70 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Usp38Q8BW70 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Usp38Q8BW70 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Usp38Q8BW70 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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