Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Atg4cQ811C2 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Atg4cQ811C2 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Atg4cQ811C2 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Atg4cQ811C2 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Atg4cQ811C2 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Atg4cQ811C2 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Atg4cQ811C2 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Atg4cQ811C2 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Atg4cQ811C2 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Atg4cQ811C2 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.7 ms