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Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8
Sgo2, Shugoshin 2, mouse
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Sgo2
Q7TSY8
n-R5s6-201
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BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
Sgo2
Q7TSY8
Gm25393-201
ENSMUST00000157336
285 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
Sgo2
Q7TSY8
Gm24476-201
ENSMUST00000157437
131 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
Sgo2
Q7TSY8
Gm25267-201
ENSMUST00000158522
63 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
Sgo2
Q7TSY8
Gm25771-201
ENSMUST00000158565
144 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
Sgo2
Q7TSY8
Vmn2r-ps78-201
ENSMUST00000173350
308 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
Sgo2
Q7TSY8
Gm45859-201
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214 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
Sgo2
Q7TSY8
Gm25814-201
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107 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
Sgo2
Q7TSY8
Gm26326-201
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129 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
Sgo2
Q7TSY8
Mir384-201
ENSMUST00000083565
88 nt
BASIC
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□□□□□ -2.35
Sgo2
Q7TSY8
Gm25611-201
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133 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
Sgo2
Q7TSY8
Gm24867-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.35
Sgo2
Q7TSY8
Mir881-201
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78 nt
BASIC
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□□□□□ -2.35
Sgo2
Q7TSY8
Gm23987-201
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129 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
Sgo2
Q7TSY8
Tra2b-ps-201
ENSMUST00000119906
168 nt
BASIC
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□□□□□ -2.35
Sgo2
Q7TSY8
Gm12815-201
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135 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
Sgo2
Q7TSY8
Gm26026-201
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123 nt
BASIC
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□□□□□ -2.35
Sgo2
Q7TSY8
Gm25720-201
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105 nt
BASIC
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□□□□□ -2.35
Sgo2
Q7TSY8
AL627387.1-201
ENSMUST00000226063
250 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
Sgo2
Q7TSY8
Gm23969-201
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74 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
Sgo2
Q7TSY8
Rab11fip4os2-202
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355 nt
TSL 1 (best)
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm23783-201
ENSMUST00000157941
102 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm24728-201
ENSMUST00000158226
125 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm24549-201
ENSMUST00000158647
139 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm17172-201
ENSMUST00000171782
190 nt
TSL 3
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm24415-201
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107 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm44462-201
ENSMUST00000199696
129 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Olfr797-ps1-201
ENSMUST00000203614
415 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm44560-201
ENSMUST00000207816
3115 nt
BASIC
0.33
□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm43885-201
ENSMUST00000204928
2542 nt
BASIC
0.33
□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm6952-201
ENSMUST00000118629
159 nt
BASIC
0.33
□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm22999-201
ENSMUST00000157082
88 nt
BASIC
0.33
□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm26160-201
ENSMUST00000158965
63 nt
BASIC
0.33
□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm22466-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm25464-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Mir7079-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm23989-201
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BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm23838-201
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162 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm25223-201
ENSMUST00000158200
110 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm25633-201
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107 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm38364-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
AC165157.3-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm24762-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm25895-201
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100 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Snord100-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm23841-201
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114 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm14567-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm25494-201
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100 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm27905-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm43944-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
AC211878.4-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
mt-Ti-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm12837-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm26152-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm22706-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
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TSL 2
BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm25787-201
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92 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
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TSL 3
BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Vmn2r-ps116-201
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BASIC
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Sgo2
Q7TSY8
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APPRIS P1
BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
Gm27047-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Sgo2
Q7TSY8
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APPRIS P1
BASIC
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□□□□□ -2.37
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Sgo2
Q7TSY8
Gm14039-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Sgo2
Q7TSY8
Gm45541-201
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BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
Sgo2
Q7TSY8
Gm19572-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
Sgo2
Q7TSY8
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.37
Sgo2
Q7TSY8
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104 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Sgo2
Q7TSY8
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Sgo2
Q7TSY8
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110 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
Sgo2
Q7TSY8
Gm25769-201
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127 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
Sgo2
Q7TSY8
Gm27476-201
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104 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
Sgo2
Q7TSY8
Mir7010-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Sgo2
Q7TSY8
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358 nt
TSL 3
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
Sgo2
Q7TSY8
AC116319.1-201
ENSMUST00000227765
222 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
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