Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Actn1Q7TPR4 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 n-R5s96-201ENSMUST00000082574 124 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Actn1Q7TPR4 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Gm24579-201ENSMUST00000103964 144 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Actn1Q7TPR4 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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