Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0
Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mouse
Protein |
RNA |
Prediction (catRAPID) |
Interaction (Experimental data) |
Gene |
UniProt Accession |
Transcript Symbol |
Ensembl Transcript ID |
Length |
Transcript Status |
Prediction Score |
Prediction z-Score |
p-Value |
Fold Change |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm22788-201 | ENSMUST00000157876 | 61 nt | BASIC | -2,65 | □□□□□ -2,83 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm22612-201 | ENSMUST00000158293 | 101 nt | BASIC | -2,65 | □□□□□ -2,83 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm23477-201 | ENSMUST00000158882 | 128 nt | BASIC | -2,65 | □□□□□ -2,83 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Mir421-201 | ENSMUST00000083575 | 76 nt | BASIC | -2,65 | □□□□□ -2,83 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm22999-201 | ENSMUST00000157082 | 88 nt | BASIC | -2,66 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Mir451b-201 | ENSMUST00000196157 | 72 nt | BASIC | -2,66 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Igkv13-56-1-201 | ENSMUST00000198481 | 209 nt | BASIC | -2,66 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm22720-201 | ENSMUST00000122710 | 87 nt | BASIC | -2,67 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm25054-201 | ENSMUST00000157370 | 97 nt | BASIC | -2,67 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm26022-201 | ENSMUST00000158663 | 108 nt | BASIC | -2,68 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Snord123-201 | ENSMUST00000158692 | 71 nt | BASIC | -2,68 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm24818-201 | ENSMUST00000175093 | 161 nt | BASIC | -2,68 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | AC158982.2-201 | ENSMUST00000226283 | 184 nt | BASIC | -2,68 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm16053-201 | ENSMUST00000120511 | 188 nt | BASIC | -2,68 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm27297-201 | ENSMUST00000183395 | 105 nt | BASIC | -2,68 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm28283-201 | ENSMUST00000185509 | 178 nt | BASIC | -2,68 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm15077-201 | ENSMUST00000122344 | 362 nt | BASIC | -2,69 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm21060-201 | ENSMUST00000179346 | 168 nt | APPRIS P1 BASIC | -2,69 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm23805-201 | ENSMUST00000180129 | 107 nt | BASIC | -2,69 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm43114-201 | ENSMUST00000198298 | 343 nt | BASIC | -2,69 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm25204-201 | ENSMUST00000082843 | 106 nt | BASIC | -2,69 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Mir302d-201 | ENSMUST00000083513 | 66 nt | BASIC | -2,69 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm24171-201 | ENSMUST00000104126 | 131 nt | BASIC | -2,7 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm11936-201 | ENSMUST00000118323 | 160 nt | BASIC | -2,7 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm24042-201 | ENSMUST00000083114 | 103 nt | BASIC | -2,7 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm23182-201 | ENSMUST00000158688 | 135 nt | BASIC | -2,71 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm43884-201 | ENSMUST00000204251 | 559 nt | BASIC | -2,71 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm24612-201 | ENSMUST00000083267 | 107 nt | BASIC | -2,71 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Mir369-201 | ENSMUST00000083627 | 79 nt | BASIC | -2,71 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm23013-201 | ENSMUST00000104146 | 106 nt | BASIC | -2,72 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm24596-201 | ENSMUST00000122504 | 107 nt | BASIC | -2,72 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm27510-201 | ENSMUST00000158214 | 64 nt | BASIC | -2,72 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm23194-201 | ENSMUST00000158813 | 105 nt | BASIC | -2,72 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm25245-201 | ENSMUST00000178139 | 107 nt | BASIC | -2,72 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm23610-201 | ENSMUST00000178659 | 107 nt | BASIC | -2,72 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm23712-201 | ENSMUST00000179713 | 107 nt | BASIC | -2,72 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm24870-201 | ENSMUST00000179897 | 107 nt | BASIC | -2,72 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm22645-201 | ENSMUST00000180010 | 107 nt | BASIC | -2,72 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm25327-201 | ENSMUST00000180263 | 107 nt | BASIC | -2,72 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Mir136-201 | ENSMUST00000199494 | 62 nt | BASIC | -2,72 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm44589-201 | ENSMUST00000207025 | 115 nt | BASIC | -2,72 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm22749-201 | ENSMUST00000082490 | 107 nt | BASIC | -2,72 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm23057-201 | ENSMUST00000082801 | 107 nt | BASIC | -2,72 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm25577-201 | ENSMUST00000083414 | 107 nt | BASIC | -2,72 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm24448-201 | ENSMUST00000083979 | 107 nt | BASIC | -2,72 | □□□□□ -2,84 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm24250-201 | ENSMUST00000157320 | 135 nt | BASIC | -2,73 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Atp2b4-208 | ENSMUST00000167348 | 243 nt | BASIC | -2,73 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm17522-202 | ENSMUST00000186631 | 174 nt | TSL 1 (best) BASIC | -2,73 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm17412-202 | ENSMUST00000189566 | 174 nt | TSL 1 (best) BASIC | -2,73 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm25588-201 | ENSMUST00000082501 | 140 nt | BASIC | -2,73 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Traj33-201 | ENSMUST00000103708 | 57 nt | APPRIS P1 BASIC | -2,73 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm25417-201 | ENSMUST00000104212 | 131 nt | BASIC | -2,73 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm25275-201 | ENSMUST00000104297 | 129 nt | BASIC | -2,73 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Vmn1r-ps1-201 | ENSMUST00000118738 | 573 nt | BASIC | -2,73 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm24618-201 | ENSMUST00000177718 | 94 nt | BASIC | -2,73 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm23953-201 | ENSMUST00000178214 | 94 nt | BASIC | -2,73 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm26332-201 | ENSMUST00000179813 | 94 nt | BASIC | -2,73 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm22863-201 | ENSMUST00000180265 | 94 nt | BASIC | -2,73 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm26456-201 | ENSMUST00000082831 | 111 nt | BASIC | -2,73 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Mir702-201 | ENSMUST00000102285 | 109 nt | BASIC | -2,74 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Vmn1r-ps116-201 | ENSMUST00000121544 | 292 nt | BASIC | -2,74 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm25656-201 | ENSMUST00000158466 | 66 nt | BASIC | -2,74 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Mir1839-201 | ENSMUST00000175366 | 127 nt | BASIC | -2,74 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm10226-201 | ENSMUST00000072133 | 255 nt | APPRIS P1 BASIC | -2,74 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm24854-201 | ENSMUST00000158025 | 98 nt | BASIC | -2,75 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm22392-201 | ENSMUST00000177971 | 107 nt | BASIC | -2,75 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Olfr719-ps-201 | ENSMUST00000137795 | 252 nt | BASIC | -2,76 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm25284-201 | ENSMUST00000180345 | 141 nt | BASIC | -2,76 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm23242-201 | ENSMUST00000083055 | 107 nt | BASIC | -2,76 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm13922-201 | ENSMUST00000119505 | 156 nt | BASIC | -2,77 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Ranbp2-ps4-201 | ENSMUST00000183481 | 385 nt | BASIC | -2,77 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Mir6336-201 | ENSMUST00000183581 | 130 nt | BASIC | -2,77 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Mir20b-201 | ENSMUST00000102087 | 80 nt | BASIC | -2,78 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Mir6411-201 | ENSMUST00000183556 | 108 nt | BASIC | -2,78 | □□□□□ -2,85 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm14599-201 | ENSMUST00000120469 | 474 nt | BASIC | -2,78 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Mir450-2-201 | ENSMUST00000102444 | 69 nt | BASIC | -2,79 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm23661-201 | ENSMUST00000122630 | 87 nt | BASIC | -2,79 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm24440-201 | ENSMUST00000157236 | 63 nt | BASIC | -2,79 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm23751-201 | ENSMUST00000157583 | 136 nt | BASIC | -2,79 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm24512-201 | ENSMUST00000174963 | 65 nt | BASIC | -2,79 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm11168-203 | ENSMUST00000178348 | 672 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | -2,79 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Mir218-1-201 | ENSMUST00000083669 | 110 nt | BASIC | -2,79 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm11407-201 | ENSMUST00000120362 | 1058 nt | BASIC | -2,81 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Snord2-201 | ENSMUST00000157899 | 69 nt | BASIC | -2,81 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm25235-201 | ENSMUST00000179933 | 107 nt | BASIC | -2,81 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm42795-201 | ENSMUST00000198847 | 76 nt | BASIC | -2,81 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm24640-201 | ENSMUST00000116949 | 126 nt | BASIC | -2,82 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm22626-201 | ENSMUST00000116990 | 126 nt | BASIC | -2,82 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm26262-201 | ENSMUST00000158024 | 127 nt | BASIC | -2,82 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm17332-201 | ENSMUST00000165626 | 87 nt | APPRIS P1 BASIC | -2,82 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm26916-201 | ENSMUST00000183304 | 352 nt | TSL 5 BASIC | -2,82 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Mir195b-201 | ENSMUST00000184814 | 97 nt | BASIC | -2,82 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm42164-201 | ENSMUST00000198881 | 379 nt | BASIC | -2,82 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm5002-201 | ENSMUST00000207145 | 223 nt | BASIC | -2,82 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | AC168880.2-201 | ENSMUST00000224488 | 201 nt | BASIC | -2,82 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | AC112972.1-201 | ENSMUST00000227329 | 365 nt | BASIC | -2,82 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | AC132833.2-201 | ENSMUST00000228699 | 157 nt | BASIC | -2,82 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm22248-201 | ENSMUST00000082482 | 150 nt | BASIC | -2,82 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm25121-201 | ENSMUST00000179846 | 79 nt | BASIC | -2,83 | □□□□□ -2,86 | | |
Ncapd3 | Q6ZQK0 | Gm22305-201 | ENSMUST00000082690 | 108 nt | BASIC | -2,83 | □□□□□ -2,86 | | |
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