Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22950-201ENSMUST00000082776 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Pdzrn3Q69ZS0 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Pdzrn3Q69ZS0 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Pdzrn3Q69ZS0 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Pdzrn3Q69ZS0 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23244-201ENSMUST00000083375 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23652-201ENSMUST00000116752 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23038-201ENSMUST00000083873 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Pdzrn3Q69ZS0 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26104-201ENSMUST00000157250 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25022-201ENSMUST00000102205 83 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mir467a-6-201ENSMUST00000177790 83 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mir467a-3-201ENSMUST00000178082 83 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mir467a-7-201ENSMUST00000178635 83 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mir467a-10-201ENSMUST00000179320 83 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mir467a-5-201ENSMUST00000179352 83 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mir467a-2-201ENSMUST00000179447 83 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mir467a-9-201ENSMUST00000179752 83 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mir467a-4-201ENSMUST00000179923 83 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mir467a-8-201ENSMUST00000180070 83 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26253-201ENSMUST00000122493 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22251-201ENSMUST00000083216 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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