Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Meis1Q60954 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Meis1Q60954 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Meis1Q60954 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Meis1Q60954 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Meis1Q60954 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Meis1Q60954 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Meis1Q60954 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Meis1Q60954 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Meis1Q60954 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Meis1Q60954 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Meis1Q60954 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Meis1Q60954 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Meis1Q60954 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Meis1Q60954 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Meis1Q60954 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Mir450b-201ENSMUST00000102095 82 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm22845-201ENSMUST00000157712 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 AC160962.3-201ENSMUST00000225914 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm25978-201ENSMUST00000158698 90 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Meis1Q60954 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Meis1Q60954 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.8 ms