Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm23180-201ENSMUST00000158686 125 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Mirlet7d-201ENSMUST00000083519 103 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 AC125190.3-201ENSMUST00000223224 121 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s8-201ENSMUST00000104121 118 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Mir3101-201ENSMUST00000175607 88 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Traj9-201ENSMUST00000103731 58 ntAPPRIS P1 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm25472-201ENSMUST00000175454 78 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Snora62-201ENSMUST00000082991 149 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm27884-201ENSMUST00000183865 76 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm23690-201ENSMUST00000083036 94 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm22048-201ENSMUST00000104721 89 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Snord67-201ENSMUST00000104033 111 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm24793-201ENSMUST00000104289 132 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.12□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Mir5124b-201ENSMUST00000184251 85 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Mir669f-201ENSMUST00000103850 121 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Mir18b-201ENSMUST00000103923 83 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC-1.15□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
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