Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rnf40Q3U319 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rnf40Q3U319 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rnf40Q3U319 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rnf40Q3U319 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rnf40Q3U319 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rnf40Q3U319 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rnf40Q3U319 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
Rnf40Q3U319 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf40Q3U319 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf40Q3U319 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf40Q3U319 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf40Q3U319 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf40Q3U319 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf40Q3U319 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf40Q3U319 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf40Q3U319 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf40Q3U319 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf40Q3U319 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf40Q3U319 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf40Q3U319 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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Rnf40Q3U319 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf40Q3U319 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf40Q3U319 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf40Q3U319 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf40Q3U319 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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Rnf40Q3U319 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf40Q3U319 Gm21836-201ENSMUST00000178787 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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Rnf40Q3U319 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf40Q3U319 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf40Q3U319 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnf40Q3U319 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnf40Q3U319 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnf40Q3U319 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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Rnf40Q3U319 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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Rnf40Q3U319 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rnf40Q3U319 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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Rnf40Q3U319 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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Rnf40Q3U319 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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