Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Trim71Q1PSW8 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Trim71Q1PSW8 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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