Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Gm23244-201ENSMUST00000083375 92 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Gm22429-201ENSMUST00000158553 130 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm25887-201ENSMUST00000157777 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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ptchd1Q14B62 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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ptchd1Q14B62 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm44932-201ENSMUST00000206799 121 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
ptchd1Q14B62 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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ptchd1Q14B62 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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