Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm44457-201ENSMUST00000198109 76 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC0.18□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC0.17□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Rpusd3Q14AI6 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC0.15□□□□□ -2.39
Rpusd3Q14AI6 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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