Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm26485-201ENSMUST00000158019 64 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Mir5117-201ENSMUST00000083226 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm11966-201ENSMUST00000119907 87 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm24384-201ENSMUST00000122693 75 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm22732-201ENSMUST00000158093 121 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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Sh3bp2Q06649 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Sh3bp2Q06649 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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Sh3bp2Q06649 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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Sh3bp2Q06649 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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Sh3bp2Q06649 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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Sh3bp2Q06649 Gm25798-201ENSMUST00000082641 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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Sh3bp2Q06649 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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Sh3bp2Q06649 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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Sh3bp2Q06649 Gm23726-201ENSMUST00000178937 67 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.9 ms