Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm26374-201ENSMUST00000179737 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm24040-201ENSMUST00000179786 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm25017-201ENSMUST00000179805 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm23618-201ENSMUST00000179912 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm26284-201ENSMUST00000180107 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm24570-201ENSMUST00000180314 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm24654-201ENSMUST00000180315 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm26054-201ENSMUST00000083037 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Hoxd1Q01822 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm12086-201ENSMUST00000120863 228 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm42844-201ENSMUST00000200355 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Mir466-201ENSMUST00000093591 73 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Hoxd1Q01822 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.9 ms