Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.32□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Gm26395-201ENSMUST00000104094 132 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Traj35-201ENSMUST00000103706 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Gm22942-201ENSMUST00000158563 124 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Gm26210-201ENSMUST00000158680 91 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Mir214-201ENSMUST00000083582 110 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Gm22962-201ENSMUST00000157962 73 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Rpl28P41105 Mir669f-201ENSMUST00000103850 121 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Mir3065-201ENSMUST00000198674 87 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm23749-201ENSMUST00000104223 131 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm27607-201ENSMUST00000185162 122 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm25885-201ENSMUST00000157779 109 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm24884-201ENSMUST00000158784 119 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Mir5124a-201ENSMUST00000175528 72 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms