Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RxraP28700 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RxraP28700 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RxraP28700 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RxraP28700 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RxraP28700 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RxraP28700 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RxraP28700 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RxraP28700 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RxraP28700 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RxraP28700 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RxraP28700 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RxraP28700 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RxraP28700 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RxraP28700 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RxraP28700 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RxraP28700 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RxraP28700 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
RxraP28700 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RxraP28700 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RxraP28700 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RxraP28700 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm23260-201ENSMUST00000158317 172 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RxraP28700 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RxraP28700 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RxraP28700 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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