Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CntfrO88507 CT030166.3-201ENSMUST00000223203 193 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CntfrO88507 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CntfrO88507 Gm25703-201ENSMUST00000083123 151 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CntfrO88507 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CntfrO88507 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CntfrO88507 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
CntfrO88507 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
CntfrO88507 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CntfrO88507 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CntfrO88507 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CntfrO88507 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CntfrO88507 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm22077-201ENSMUST00000157594 93 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CntfrO88507 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Mir672-201ENSMUST00000102331 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Mir670-201ENSMUST00000102380 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm25772-201ENSMUST00000158574 56 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm24218-201ENSMUST00000180163 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CntfrO88507 mt-Tl1-201ENSMUST00000082391 75 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CntfrO88507 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 226.5 ms