Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC0.46□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm26285-201ENSMUST00000177923 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm23622-201ENSMUST00000082460 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm24963-201ENSMUST00000157916 144 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Eftud2O08810 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm23126-201ENSMUST00000104260 134 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm23672-201ENSMUST00000157471 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm22759-201ENSMUST00000102276 96 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm23969-201ENSMUST00000083324 74 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Eftud2O08810 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms