Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm25791-201ENSMUST00000083292 137 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Mir3470a-201ENSMUST00000175223 77 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Mir214-201ENSMUST00000083582 110 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Zfp558E9Q1J0 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm26210-201ENSMUST00000158680 91 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Mir141-201ENSMUST00000083540 72 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
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Zfp558E9Q1J0 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.33□□□□□ -2.46
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Zfp558E9Q1J0 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Mir3065-201ENSMUST00000198674 87 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC-0.33□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm25338-201ENSMUST00000116849 120 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm25149-201ENSMUST00000157119 82 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm24884-201ENSMUST00000158784 119 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Zfp558E9Q1J0 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Zfp558E9Q1J0 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
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