Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc6D3YZP9 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc6D3YZP9 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc6D3YZP9 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc6D3YZP9 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc6D3YZP9 Gm22048-201ENSMUST00000104721 89 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc6D3YZP9 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc6D3YZP9 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc6D3YZP9 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc6D3YZP9 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc6D3YZP9 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc6D3YZP9 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc6D3YZP9 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc6D3YZP9 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc6D3YZP9 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc6D3YZP9 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc6D3YZP9 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Mir6904-201ENSMUST00000183443 67 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm27977-201ENSMUST00000185159 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Mir3109-201ENSMUST00000175301 88 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc6D3YZP9 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Mir6389-201ENSMUST00000183661 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm26285-201ENSMUST00000177923 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm23622-201ENSMUST00000082460 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm25885-201ENSMUST00000157779 109 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.3 ms