Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Mir3967-201ENSMUST00000198710 68 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm44803-201ENSMUST00000204384 156 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
Phf11bB4XVQ1 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Mir574-201ENSMUST00000103854 78 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm24372-201ENSMUST00000104400 110 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm25149-201ENSMUST00000157119 82 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm25791-201ENSMUST00000083292 137 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm24296-201ENSMUST00000158297 106 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm26210-201ENSMUST00000158680 91 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Mir466m-201ENSMUST00000175052 84 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm22324-201ENSMUST00000158903 114 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Phf11bB4XVQ1 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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