Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm23826-201ENSMUST00000157394 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm25229-201ENSMUST00000178587 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm25354-201ENSMUST00000179110 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Spocd1B1ASB6 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm22458-201ENSMUST00000082576 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm22522-201ENSMUST00000158271 151 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm27987-201ENSMUST00000184023 93 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm25696-201ENSMUST00000082900 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm25644-201ENSMUST00000083209 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 mt-Tl2-201ENSMUST00000082417 71 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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