Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Grik3B1AS29 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Grik3B1AS29 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Grik3B1AS29 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Grik3B1AS29 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Grik3B1AS29 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Grik3B1AS29 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Grik3B1AS29 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Grik3B1AS29 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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