Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Atp8b5A3FIN4 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Atp8b5A3FIN4 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Atp8b5A3FIN4 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Atp8b5A3FIN4 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Atp8b5A3FIN4 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Mir7077-201ENSMUST00000183991 57 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Atp8b5A3FIN4 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Mir200a-201ENSMUST00000083466 90 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Atp8b5A3FIN4 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 268.5 ms