Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.54□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 Gm22302-201ENSMUST00000082657 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 Mir216a-201ENSMUST00000083605 72 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.53□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Nrf1Q9WU00 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm26236-201ENSMUST00000175536 137 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 mt-Tm-201ENSMUST00000082395 69 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm26285-201ENSMUST00000177923 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 AC124196.2-201ENSMUST00000224835 145 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm23622-201ENSMUST00000082460 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm27289-201ENSMUST00000183341 82 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm43432-201ENSMUST00000196352 121 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Nrf1Q9WU00 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Nrf1Q9WU00 Gm25378-201ENSMUST00000104333 129 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Nrf1Q9WU00 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.2 ms