Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Mir467a-5-201ENSMUST00000179352 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Mir467a-2-201ENSMUST00000179447 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Mir467a-9-201ENSMUST00000179752 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Mir467a-4-201ENSMUST00000179923 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Mir467a-8-201ENSMUST00000180070 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rabgef1Q9JM13 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm25978-201ENSMUST00000158698 90 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm22950-201ENSMUST00000082776 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm22251-201ENSMUST00000083216 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm23038-201ENSMUST00000083873 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rabgef1Q9JM13 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm23817-201ENSMUST00000158449 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm26104-201ENSMUST00000157250 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rabgef1Q9JM13 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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