Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm25646-201ENSMUST00000178527 79 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm12086-201ENSMUST00000120863 228 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm25098-201ENSMUST00000177580 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm23356-201ENSMUST00000177610 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm24027-201ENSMUST00000177611 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm22511-201ENSMUST00000177628 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm22630-201ENSMUST00000177781 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm23560-201ENSMUST00000177782 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm25462-201ENSMUST00000177833 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm26059-201ENSMUST00000177865 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm22255-201ENSMUST00000177933 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm25146-201ENSMUST00000177976 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm25523-201ENSMUST00000178044 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm24585-201ENSMUST00000178104 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm22627-201ENSMUST00000178127 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm22912-201ENSMUST00000178242 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm24866-201ENSMUST00000178338 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm22524-201ENSMUST00000178357 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm25710-201ENSMUST00000178367 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm23575-201ENSMUST00000178406 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm24872-201ENSMUST00000178434 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm22449-201ENSMUST00000178924 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm24702-201ENSMUST00000178965 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm24206-201ENSMUST00000179011 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm24528-201ENSMUST00000179164 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm22909-201ENSMUST00000179190 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm26334-201ENSMUST00000179403 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm25463-201ENSMUST00000179405 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm25742-201ENSMUST00000179530 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm25209-201ENSMUST00000179576 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm26392-201ENSMUST00000179661 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm25230-201ENSMUST00000179740 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm26434-201ENSMUST00000179778 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm25741-201ENSMUST00000179825 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm24759-201ENSMUST00000179827 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm24219-201ENSMUST00000179861 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm23254-201ENSMUST00000097244 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm25380-201ENSMUST00000175463 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm24641-201ENSMUST00000178055 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm25484-201ENSMUST00000178217 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm26138-201ENSMUST00000179236 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm22821-201ENSMUST00000179288 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm23298-201ENSMUST00000083181 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm24614-201ENSMUST00000083269 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm22057-201ENSMUST00000083387 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm25516-201ENSMUST00000083857 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm25753-201ENSMUST00000116792 121 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Snora2b-201ENSMUST00000084005 137 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
RabggtaQ9JHK4 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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