Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC0□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm22048-201ENSMUST00000104721 89 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm24467-201ENSMUST00000157887 126 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm23821-201ENSMUST00000158738 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm38208-201ENSMUST00000192476 114 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm25703-201ENSMUST00000083123 151 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Mir7229-201ENSMUST00000197062 53 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cldn22Q9D7U6 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Mir382-201ENSMUST00000083494 76 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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Cldn22Q9D7U6 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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Cldn22Q9D7U6 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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Cldn22Q9D7U6 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Traj35-201ENSMUST00000103706 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Cldn22Q9D7U6 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.3 ms