Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm23969-201ENSMUST00000083324 74 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm24963-201ENSMUST00000157916 144 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm22759-201ENSMUST00000102276 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.39□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Zbed3Q9D0L1 Mir7077-201ENSMUST00000183991 57 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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