Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm22681-201ENSMUST00000083853 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Afg3l1Q920A7 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Afg3l1Q920A7 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms