Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Usp38Q8BW70 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
Usp38Q8BW70 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.14
Usp38Q8BW70 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Usp38Q8BW70 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Usp38Q8BW70 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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