Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NipblQ6KCD5 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NipblQ6KCD5 Gm25619-201ENSMUST00000122621 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NipblQ6KCD5 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NipblQ6KCD5 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NipblQ6KCD5 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
NipblQ6KCD5 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NipblQ6KCD5 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NipblQ6KCD5 Gm22455-201ENSMUST00000082580 71 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NipblQ6KCD5 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NipblQ6KCD5 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NipblQ6KCD5 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NipblQ6KCD5 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NipblQ6KCD5 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NipblQ6KCD5 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NipblQ6KCD5 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NipblQ6KCD5 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NipblQ6KCD5 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NipblQ6KCD5 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm25870-201ENSMUST00000179845 79 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm23570-201ENSMUST00000083029 104 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm24064-201ENSMUST00000157486 106 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm22305-201ENSMUST00000082690 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm42677-201ENSMUST00000196363 127 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.25□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm25296-201ENSMUST00000082566 67 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm22783-201ENSMUST00000104089 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm24185-201ENSMUST00000122578 105 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm25112-201ENSMUST00000122680 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm26438-201ENSMUST00000082593 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Mir23a-201ENSMUST00000083677 75 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Mir2136-201ENSMUST00000158781 75 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm27366-201ENSMUST00000184967 108 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NipblQ6KCD5 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
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