Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC-0.94□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm23749-201ENSMUST00000104223 131 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Mir103-1-201ENSMUST00000083619 86 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 AC129019.2-201ENSMUST00000222063 202 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm26007-201ENSMUST00000158798 120 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm24593-201ENSMUST00000122507 106 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm25885-201ENSMUST00000157779 109 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Mir378c-201ENSMUST00000184478 99 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC-1□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.01□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.01□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm11116-201ENSMUST00000113257 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 Mir96-201ENSMUST00000083652 106 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Sft2d1Q5SSN7 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
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