Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm26230-201ENSMUST00000180141 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Mir450b-201ENSMUST00000102095 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Gm22845-201ENSMUST00000157712 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Gm25978-201ENSMUST00000158698 90 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 AC160962.3-201ENSMUST00000225914 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Usp48Q3V0C5 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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Usp48Q3V0C5 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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Usp48Q3V0C5 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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Usp48Q3V0C5 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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Usp48Q3V0C5 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Usp48Q3V0C5 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp48Q3V0C5 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp48Q3V0C5 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp48Q3V0C5 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp48Q3V0C5 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp48Q3V0C5 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp48Q3V0C5 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp48Q3V0C5 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp48Q3V0C5 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp48Q3V0C5 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp48Q3V0C5 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp48Q3V0C5 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp48Q3V0C5 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp48Q3V0C5 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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