Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Mir6481-201ENSMUST00000184617 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Trim71Q1PSW8 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Trim71Q1PSW8 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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