Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 AC160962.3-201ENSMUST00000225914 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
ptchd1Q14B62 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm25978-201ENSMUST00000158698 90 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ptchd1Q14B62 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ptchd1Q14B62 Gm22212-201ENSMUST00000158096 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.6 ms