Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm23672-201ENSMUST00000157471 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm44828-201ENSMUST00000203745 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC0.29□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Rpusd3Q14AI6 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm23126-201ENSMUST00000104260 134 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm23969-201ENSMUST00000083324 74 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Rpusd3Q14AI6 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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