Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm25417-201ENSMUST00000104212 131 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm23376-201ENSMUST00000082938 160 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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Sh3bp2Q06649 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm23785-201ENSMUST00000116741 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm24162-201ENSMUST00000093665 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Gm24988-201ENSMUST00000104460 121 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Sh3bp2Q06649 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Sh3bp2Q06649 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Sh3bp2Q06649 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Sh3bp2Q06649 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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Sh3bp2Q06649 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Sh3bp2Q06649 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Sh3bp2Q06649 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Gm25322-201ENSMUST00000122556 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Gm24199-201ENSMUST00000157808 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
Sh3bp2Q06649 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.3 ms